Ο ρόλος του ΡΕΤ στον έλεγχο πρώιμης ανταπόκρισης στην θεραπεία είναι σημαντικός. Οι συμβατικές μέθοδοι απεικόνισης αδυνατούν να δείξουν το αποτέλεσμα της θεραπείας που ακολουθήθηκε αμέσως μετά το τέλος της θεραπείας και συνήθως χρειάζονται να περάσει ένα διάστημα μερικών μηνών για να μπορέσουν να αξιολογήσουν το αποτέλεσμα. Αντίθετα η εξέταση ΡΕΤ μπορεί να δείξει την αλλαγή στο μεταβολισμό του όγκου λόγω της επίδρασης της θεραπείας, σχεδόν σε πραγματικό χρόνο (πολύ πρώιμα).
Για την παρακολούθηση της θεραπείας, η εξέταση μπορεί να γίνει έως και μια με δυο μέρες μετά τη θεραπεία. Για την επανασταδιοποίηση του ασθενούς μετά τη θεραπεία όμως η εξέταση θα πρέπει να γίνει με κάποια χρονική καθυστέρηση, όσο αυτό είναι εφικτό. Επίσης η εξέταση μπορεί να βοηθήσει στο να αποφασιστεί το κατά πόσο χρειάζεται συμπληρωματική χημειοθεραπεία. Σε αυτή την περίπτωση η εξέταση πρέπει να γίνει αμέσως πριν την έναρξη του επόμενου κύκλου.
Για την παρακολούθηση της θεραπείας, η εξέταση μπορεί να γίνει έως και μια με δυο μέρες μετά τη θεραπεία. Για την επανασταδιοποίηση του ασθενούς μετά τη θεραπεία όμως η εξέταση θα πρέπει να γίνει με κάποια χρονική καθυστέρηση, όσο αυτό είναι εφικτό. Επίσης η εξέταση μπορεί να βοηθήσει στο να αποφασιστεί το κατά πόσο χρειάζεται συμπληρωματική χημειοθεραπεία. Σε αυτή την περίπτωση η εξέταση πρέπει να γίνει αμέσως πριν την έναρξη του επόμενου κύκλου.